檀国大学拥有2所院区所组成的大规模综合性大学，共设有设有25个学部和系、100个专业。硕士研究生院有63个系，博士研究生院有51个系。

院系设置：文理学院、国际大学院（中韩翻译系）、社会科学院、商经学院、指导学院（韩文教育系、特殊教育系）、自然科学学院、建筑学院、工科大学、司法大学、艺术造型学院、音乐学院、人文科学学院、法定学院、经商学院、尖端科学学院、医科学院、牙科学院、生命资源学院、艺术学院、体育学院。

文理学院：韩国语言文学系、历史系、哲学、英美文学系

法学院：法律

社会科学学院：政治学与国际关系系、媒体与传播学院、公共行政学系、咨询部、城市规划与房地产学院

商业与经济学院：经济学系、贸易部、工商管理系、产业管理系、国际商务系

工程学院：电子与电气工程系、土木与环境工程系、建筑系、融合牛导体工程系、机械工程系、工程教育创新中心、高分子系统工程学院、化学工程系

SW Convergence College：软件系、计算机科学与工程系、移动系统工程系、统计与数据科学系、网络安全系、软件融合系

教育学院：中国文学系、特殊教育系、数学教育系、科学教育系、体育系、教育教学系

音乐与艺术学院：陶瓷系、舞蹈系、设计系、音乐系、表演艺术与电影系

自由文理学院：自由文理系

产学合作融合学院：产学合作融合

外国语学院：亚洲与中东研究学院、英语系、欧洲及拉丁美洲系、全球韩语

科学技术学院：数学、食品与营养学系、管理工程系、物理系、材料科学与工程系、制药工程系、化学、能源工程系、科学技术学院教授

生物融合学院：生命资源系、生物医学系、食品科学与技术系、医疗材料系

艺术学院：美术系、创意写作系、新音乐系

体育科学学院：生活与体育系、体育管理系、国际体育系

公共人事学院：公共政策系、海军陆战队军事研究系、食品与资源经济学系、社会福利部

健康科学学院：临床病理学系、口腔卫生学系、物理治疗系、心理治疗学系、卫生行政学系

护理学院：护理学系

牙医学院：牙医预科、牙科系

药学院：药剂学系